기본 콘텐츠로 건너뛰기

AIDS 에 대해서 알아보자 (2)






 2. HIV 의 구조와 증식 


 HIV 는 다른 바이러스와 마찬가지로 기본적인 구조는 유전자와 일부 효소를 둘러싼 막이 존재하고 이 막에는 바이러스가 숙주세포에 달라붙어 내부로 침투하는 데 필요한 구조물들이 달려 있는 구조입니다. 크기는 대략 120 nm 지름의 울퉁불퉁한 공을 생각하면 됩니다. 이는 바이러스 치곤 약간 큰축에 속하지만 실제로는 여전히 적혈구 지름의 1/60 정도 수준입니다. 



 (HIV 의 다이어그램    

US National Institute of Health (redrawn by en:User:Carl Henderson)
  
public domain)  


 바이러스의 중심부에는 바이러스 존재의 궁극적 목표라고 할 수 있는 두 카피의 single - stranded RNA 가 존재합니다. 이 RNA 를 증식하고 전파하는 것이 HIV 바이러스가 하는 일이라고 할 수 있겠죠. RNA 는 9749 개의 뉴클레오타이드 (Nucleotide) 로 구성되어 있습니다. 이 RNA 에는 모든 레트로바이러스에 공통적으로 존재하는 주요 단백질이 코딩되어 있지만 그외에도 HIV 에서만 존재하는 일부 단백질도 코딩되어 있습니다. 



(HIV 게놈의 기본 다이어그램  Original uploader was Grcampbell at en.wikipedia GFDL-WITH-DISCLAIMERS; Released under the GNU Free Documentation License.   )


 바이러스는 대개 복제와 감염에 필요한 유전자들만 있기 때문에 유전자가 비교적 단순한 편입니다. HIV 에서 중요한 유전자는 

 gag (group specific antigen) : Gag polyprotein 을 코딩하며 이는 p17 (Matrix protein, MA), p24 (Capsid protein), p2 (spacer peptide 1), p7 (Nucleocapsid protein, NC), p1 (SP2 spacer protein  2), p6 를 완성시키는 데 필요한 단백질임. 

 pol : 바이러스 효소 reverse transcriptase, integrase, HIV protease 를 코딩 

 env (envelope) :  gp 160  을 코딩하며 이는 표면 단백질인 gp 120 및 gp 41 의 전구물질임. 이 단백질들은 바이러스 표면에 있으면서 표적 세포에 부착해 내부로 들어가는 역활을 함. 


 이 RNA 는 p24 라는 capsid protein 으로 이루어진 막속에 존재합니다. (제일 위의 파란색으로 된 capsid) 그리고 역전사 효소 (reverse transcriptase) 라는 효소가 같이 들어있는데 이 효소가 하는 일은 바이러스의 RNA 가 숙주 세포내로 들어가면 숙주 세포의 자원을 이용해서 ss RNA 를 ss DNA (single strand DNA) 로 변경시켜 증식하는 역활을 합니다. 


 보통의 DNA polymerase 는 DNA 를 주형으로 삼아 RNA 를 만들고 RNA 에서 각종 단백질을 만들어내게 되지만 이 효소는 반대로 RNA 를 주형으로 DNA 를 생산하기 때문에 반대라는 의미의 역전사 효소라고 부릅니다. 하지만 대개 역전사 효소는 DNA 를 주형으로 DNA 를 양산하는 역활도 합니다. 간단하게 말해 역전사 효소는 숙주 세포내로 바이러스의 RNA 가 들어가면 이를 DNA 로 바꿔 대량으로 바이러스의 유전자를 복사합니다. 


 이 유전자들은 다시 숙주세포의 자원을 이용해 바이러스의 외피, 유전자, 효소, 기타 단백질을 합성하는 일을 하고 마지막 단계에서 충분한 수의 부품들이 완성되면 이들이 뭉쳐서 새로운 HIV 가 된 후 세포가 파괴되면서 대량으로 증식된 바이러스가 탄생해 새로운 숙주세포를 노리게 됩니다. 


 이제 이 기본적인 바이러스의 구조를 바탕으로 바이러스의 증식에 대해서 설명해 봅니다. 




(HIV 의 증식 사이클 Original uploader was Raul654 at en.wikipedia Later version(s) were uploaded by Grcampbell, Renegadeviking, Disparity at en.wikipedia   ) 


 바이러스의 표면에 존재하는 gp 120 및 gp 41 이 HIV 가 인간의 면역 세포에 들어가는 데 중요한 역활을 합니다. gp120 은 인간의 다양한 면역 세포에 존재하는 표면 단백질인 CD4 receptor 와 결합하는 역활을 하는데 대표적으로 helper T cell 이 그 타겟입니다. gp 41 은 비 공유 결합 형태로  gp 120 과 붙어있다가 일단 gp120 과 CD4 receptor 가 결합하면 숙주세포와 융합해 바이러스의 내부 물질 (즉 RNA 및 효소) 를 숙주세포 내부로 투입합니다. 


들어간 바이러스 RNA 는 숙주 세포 (대식 세포 (macrophage) 및 CD4+ T cell) 에서 마치 숙주 자체의 유전자인 것처럼 숙주를 속여서 증식하기 위해 역전사 효소에 의해서 DNA 로 변경된 후 integrase 라는 효소의 도움을 받아 숙주 세포에 DNA 속으로 끼어들어 갑니다.


 이후 숙주세포는 바이러스의 DNA 를 주물로 RNA를 대량으로 생산하게 되는데 이 RNA 를 이용해서 아미노산을 연결해 단백질을 만들면 위에 그림에 존재하는 바이러스의 여러 단백질 (예를 들어 역전사 효소나 혹은 gp 120 같은) 이 대량으로 만들어지게 됩니다. 


 이런 단백질과 RNA 가 수천개씩 만들어진 다음 서로 뭉쳐서 다시 새로운 바이러스를 만들게 됩니다. 다 만들어진 바이러스는 숙주세포의 표면에서 밖으로 나가서 또 다시 새로운 숙주세포를 찾아 다닙니다. 사실 이런 사이클 자체는 바이러스 전체에서 기본적으로 볼 수 있으며 RNA 를 DNA 로 바꾸는 과정만 레트로 바이러스 과에서 볼 수 있는 특징이라고 할 수 있습니다. (여기서는 간단히 설명했지만 실제로는 아주 간단한 내용은 아니라고 할 수 있습니다. 오해는 없으시기를 ) 


 HIV 바이러스는 인간의 체내에서 특히 면역 세포를 숙주로 삼아 증식을 하기 때문에 후천성 면역 결핍 증후군을 일으키게 됩니다. 




 참고 


댓글

이 블로그의 인기 게시물

중등도 코로나 19 환자에서 제한적인 효과만을 확인한 렘데시비르

   현재 렘데시비르는 인공 호흡기 치료가 필요한 환자 등 중증 코로나 19 환자의 치료제로 사용되고 있습니다. 다만 공급이 부족해서 갑자가 중증 코로나 19 환자가 늘어날 경우 수급 문제가 불거질 수밖에 없습니다. 따라서 이를 중등도 코로나 19 환자 (경증이나 무증상은 당연히 치료가 필요없거나 대증 요법 정도) 사용한다는 것은 지금 당장에 급한 연구는 아니지만, 나중에 수급량이 많아지고 가격이 낮아질 때를 생각하면 의미 있는 연구 결과입니다.   렘데시비르 제조사인 길리어드 사이언스의 다아애나 브레이너드 박사 ( Dr. Diana Brainard of Gilead Sciences )는 병원에 입원이 필요했던 중등도 코로나 19 환자 584명을 렘데시비르 5일, 10일 투여 실험군과 위약을 투여한 대조군으로 나눠 임상 경과, 사망 등 중요한 합병증 발생 등에서 차이를 보이는지 조사했습니다. 연구 대상자의 40% 이상은 당뇨 같은 만성 질환이 있었으며 평균 연령은 57세였습니다.   연구 결과 대조군의 2%, 5일 투여군의 2%, 10일 투여군의 1%가 사망했으나 사망자 수가 4명, 3명, 2명 정도로 통계적 차이를 판단하기에는 사망자 수가 적어 결론을 내리기 어려웠습니다. 연구팀은 5일 투여군에서 임상 경과가 다소 호전되는 것을 판단했으나 10일 투여군에서는 통계적 차이를 검증할 수 없었습니다. 결론적으로 말해 중등도 코로나 19 환자에서 렘데시비르 투여는 확실한 임상적 이득이 없었습니다.     5일 투여량만 해도 가격이 3120달러라는 점을 감안할 때 중등도 환자에서 렘데시비르 투여는 설령 공급이 원활하다고 해도 적절한 치료법이 아닌 것으로 판단됩니다. 더구나 지금처럼 공급이 불안해 중증 환자 투여 물량 확보가 아쉬운 상황에서는 말할 것도 없습니다.  이번 연구는 렘데시비르보다 효과가 뛰어나면서 저렴한 차세대 항바이러스 치료제의 필요성을 다시 보여준 것으로 생각됩니다....

178Tb/s - 광섬유 통신 신기록 수립

  ( Lidia Galdino, lead researcher on the study. Credit: James Tye / UCL )  현재 가정에 들어오는 초고속 광통신은 10Gb/s 정도가 가장 빠른 편입니다. 그러나 사실 광섬유를 통해서 보낼 수 있는 정보량은 이것보다 훨씬 많습니다. 현재 개발 중인 기술 가운데서는 이미 1Tb/s 이상이 속도를 지닌 것들이 많아 미래에는 테라 인터넷 시대가 가능할 것으로 예상됩니다. 그런 가운데 영국 유니버시티 칼리지 런던 (UCL)의 리디아 갈디노( Lidia Galdino )가 이끄는 연구팀이 178Tb/s라는 신기록을 세웠다는 소식입니다.   광섬유 통신을 위한 주파수는 4.5THz까지 높일 수 있습니다. 최근에 개발된 신기술은 9THz 벽도 돌파했습니다. 그러나 연구팀은 16.8THz라는 새로운 영역에 도달했습니다. 주파수가 높을 수록 더 많은 정보를 전송할 수 있습니다. 하지만 16.8THz의 주파수로도 178Tb/s의 데이터 전송 속도는 사실 불가능합니다. 연구팀은  Geometric Shaping (GS) 방식으로 레이저 신호의 페이즈, 밝기, 편광 수준을 조절해 여러 신호가 서로 간섭 없이 전달되게 만들어 이런 신기록을 수립했습니다.   물론 새로운 기술이 항상 그렇듯이 바로 상용화가 가능한 것은 아닙니다. 특히 광섬유는 장거리 정보 전송이 가능해야 할 뿐 아니라 오류 없이 장시간 작동이 가능해야 합니다. 자꾸 에러가 생기거나 고장난다면 아무리 속도가 빨라도 무용지물입니다. 이 단계를 극복하고 경제성까지 갖춰 실용화 되는 경우는 사실 소수에 지나지 않습니다.   하지만 경쟁적으로 Tb 급 대역폭을 지닌 광통신 기술이 개발되고 있어 테라바이트 급 정보도 순식간에 전송할 수 있는 시대가 올 것은 분명합니다. 과거 전화선을 이용한 56K 모뎀에서 지금의 광섬유 기반 초고속 인터넷이 온 것처럼 속도는 계속 빨라질 수밖에 없기 때문입니다...

코로나 19 감염 위험성이 큰 동물은?

  ( A new genomic study ranks the potential of the SARS-CoV-2 spike protein to bind to the ACE2 receptor site in 410 vertebrate animals. Old World primates and great apes, which have identical amino acids at the binding site as humans, are predicted to have a very high propensity for binding ACE2 and are likely susceptible to SARS-CoV-2 infection. Credit: Matt Verdolivo/UC Davis )    코로나 19를 일으키는  SARS-CoV-2는 사스 및 메르스와 마찬가지로 박쥐를 자연 숙주로 삼는 베타 코로나바이러스 계통입니다. 따라서 본래 박쥐에 살던 바이러스가 중간 단계를 거쳐 사람으로 넘어온 것으로 추정됩니다. 그런데 이 이야기는 SARS-CoV-2 역시 사람에만 감염되는 것이 아니라 종을 넘어 다른 포유류나 조류, 혹은 척추동물에 감염될 수 있음을 시사합니다. 코로나 바이러스가 침투하는 경로인 ACE2 수용체는 다른 척추동물에서도 볼 수 있기 때문입니다. 다만 SARS-CoV-2와 ACE2 수용체의 결합 수준은 동물마다 큰 차이가 있어 감염 위험도는 모두 다를 수밖에 없습니다.   캘리포니아 대학 데이비스 캠퍼스 (UC Davis)의 조안나 다마스 (Joana Damas)와 그 동료들은 410종의 척추동물에서 ACE2 수용체 유전자를 조사해 코로나 19 감염 위험도를 조사했습니다. 연구팀에 따르면 ACE2 수용체 전체가 아니라 25개의 아미노산 배열이 특히 결합력에 큰 영향을 미쳐 감염 가능성을 결정합니다.   연구 결과 쉽게 예상할 수 있듯이 사람과 가까운 침팬치, 고릴라, 보노보...