기본 콘텐츠로 건너뛰기

R 스튜디오 설정 및 프로젝트 관리



 대개 R 스튜디오를 처음 설치하고 나면 설정은 이것저것 건드릴게 없을 것입니다. 대개는 기본 상태로 사용하면 되고 필요에 따라 설정을 변경하면 됩니다. 설정을 다루는 곳은 Tools 에서 Global options 입니다. Global option은 모든 프로젝트에 관련된 옵션을 조절합니다. 그러나 프로젝트 옵션에서 특정 프로젝트와 연관된 옵션도 따로 적용할 수 있습니다. 






 위의 화면에서 왼쪽 위는 코드를 입력하는 콘솔 창이고 왼쪽 아래는 코드가 실행되는 창입니다. 오른쪽에는 로드한 파일, 데이터, 그리고 설명 및 그래프가 그려지는 창 등이 있습니다. 물론 각각의 창은 크기 조절이 가능하며 경우에 따라서는 몇 개의 모니터에 분리할 수 있습니다. 사용법은 차차 설명드릴 것입니다. 


 설정은 기본으로 사용해도 대개는 큰 문제는 없을 것입니다. 다만 이런 저런 이유로 설정을 조정해야 하는 경우가 생길 수는 있습니다. 예를 들어 앞서 설명한 R 버전 선택이 그런 경우입니다. 전체 설정 조정은 앞서 말한 대로 글로벌 옵션에서 조정합니다.  







 옵션에서 여러 가지 조정을 할 수 있는데, 앞서 언급했듯이 처음에는 굳이 건드릴 이유가 없습니다. 필요한 내용은 하나씩 조절을 하면 됩니다. 



 여기서 더 설명할 내용은 바로 프로젝트 관리입니다. 각각의 R 세선은 프로젝트로 관리됩니다. 처음에는 이 방식이 낯설기도 하지만, 사실 별로 필요가 없어 신경쓰지 않게 됩니다. 하지만 이렇게 굳이 만든데는 이유가 있습니다. 


 R로 여러 가지 작업을 하게 되면 코드가 매우 길어지면서 코드를 관리하기가 매우 곤란해집니다. 모든 작업을 하나의 창에 기록하다보면 수천 줄이 넘는 코드가 될 수도 있습니다. 저 같은 경우는 각 작업 당 수백 줄 이내 코드지만, 이런 작업을 여러 개 하다보면 수천 줄이 넘게 될 가능성이 높고 정리가 안되므로 각각의 작업에 따라 별개로 저장을 하게 됩니다. 프로젝트 관리는 이를 더 편하게 만들어 줍니다. 


 프로젝트를 만드는 방법은 간단합니다. 파일에서 new project 로 들어갑니다. 








 그러면 새로운 디렉토리를 사용할 것인지 기존의 디렉토리를 사용할 것인지를 물어봅니다. 보통은 새로운 디렉토리를 사용해서 작업과 코드 파일을 관리하기 때문에 new directory를 선택합니다. 



 새로운 프로젝트를 만드려면 empty project를 선택합니다. 여기서 할 것은 그것입니다. R 패키지를 만들거나 샤이니 웹 어플리케이션을 만들 수 있는 수준이라면 이미 어느 정도 수준에 이른 R 개발자라고 할 수 있는데, 이 포스트에서 당장에 다룰 내용이 아니므로 생락합니다. 




 새로운 디렉토리의 이름을 정하고 저장 위치를 조정하는 옵션이 나옵니다. 여기서는 R post로 하고 그런 폴더를 별도의 장소에 만들겠습니다. 





 그런데 여기서 중요한 부분이 있습니다. 프로젝트 별 관리의 편리성은 모아서 관리가 가능하다는 점입니다. 그런데 저장 장소를 기본으로 설정하면 문서 폴더에 새 폴더를 만들게 됩니다. 그러면 수많은 폴더 사이에 파일이 저장되므로 관리가 불편합니다. 가능하면 Browser 를 눌러서 가장 편한 폴더에 모아서 저장하는 것을 권장합니다. 이는 시간이 지나보면 편리함의 차이를 알게 될 것입니다. 


 모든 것이 다 되었다면 Create Project를 눌러 새로운 프로젝트를 만듭니다.







 위의 창에서 붉은색 화살표로 표시한 부분을 클릭하면 새로운 콘솔창이 열립니다. 그러면 이제 R 스튜디오로 코드를 입력할 준비가 된 것입니다. 





 다음에 R 에 대한 이야기를 조금 더 하고 사용법에 대한 이야기를 하겠습니다. 



댓글

이 블로그의 인기 게시물

세상에서 가장 큰 벌

( Wallace's giant bee, the largest known bee species in the world, is four times larger than a European honeybee(Credit: Clay Bolt) ) (Photographer Clay Bolt snaps some of the first-ever shots of Wallace's giant bee in the wild(Credit: Simon Robson)  월리스의 거대 벌 (Wallace’s giant bee)로 알려진 Megachile pluto는 매우 거대한 인도네시아 벌로 세상에서 가장 거대한 말벌과도 경쟁할 수 있는 크기를 지니고 있습니다. 암컷의 경우 몸길이 3.8cm, 날개너비 6.35cm으로 알려진 벌 가운데 가장 거대하지만 수컷의 경우 이보다 작아서 몸길이가 2.3cm 정도입니다. 아무튼 일반 꿀벌의 4배가 넘는 몸길이를 지닌 거대 벌이라고 할 수 있습니다.   메가칠레는 1981년 몇 개의 표본이 발견된 이후 지금까지 추가 발견이 되지 않아 멸종되었다고 보는 과학자들도 있었습니다. 2018년에 eBay에 표본이 나왔지만, 언제 잡힌 것인지는 알 수 없었습니다. 사실 이 벌은 1858년 처음 발견된 이후 1981년에야 다시 발견되었을 만큼 찾기 어려운 희귀종입니다. 그런데 시드니 대학과 국제 야생 동물 보호 협회 (Global Wildlife Conservation)의 연구팀이 오랜 수색 끝에 2019년 인도네시아의 오지에서 메가칠레 암컷을 야생 상태에서 발견하는데 성공했습니다.   메가칠레 암컷은 특이하게도 살아있는 흰개미 둥지가 있는 나무에 둥지를 만들고 살아갑니다. 이들의 거대한 턱은 나무의 수지를 모아 둥지를 짓는데 유리합니다. 하지만 워낙 희귀종이라 이들의 생태에 대해서는 거의 알려진 바가 없습니다.  (동영상)...

몸에 철이 많으면 조기 사망 위험도가 높다?

 철분은 인체에 반드시 필요한 미량 원소입니다. 헤모글로빈에 필수적인 물질이기 때문에 철분 부족은 흔히 빈혈을 부르며 반대로 피를 자꾸 잃는 경우에는 철분 부족 현상이 발생합니다. 하지만 철분 수치가 높다는 것은 반드시 좋은 의미는 아닙니다. 모든 일에는 적당한 수준이 있게 마련이고 철 역시 너무 많으면 여러 가지 질병을 일으킬 수 있습니다. 철 대사에 문제가 생겨 철이 과다하게 축적되는 혈색소증 ( haemochromatosis ) 같은 드문 경우가 아니라도 과도한 철분 섭취나 수혈로 인한 철분 과잉은 건강에 문제를 일으킬 수 있습니다. 하지만 높은 철 농도가 수명에 미치는 영향에 대해서는 잘 알려지지 않았습니다.   하버드 대학의 이야스 다글라스( Iyas Daghlas )와 임페리얼 칼리지 런던의 데펜더 길 ( Dipender Gill )은 체내 철 함유량에 영향을 미치는 유전적 변이와 수명의 관계를 조사했습니다. 연구팀은 48972명의 유전 정보와 혈중 철분 농도, 그리고 기대 수명의 60/90%에서 생존 확률을 조사했습니다. 그 결과 유전자로 예측한 혈중 철분 농도가 증가할수록 오래 생존할 가능성이 낮은 것으로 나타났습니다. 이것이 유전자 자체 때문인지 아니면 높은 혈중/체내 철 농도 때문인지는 명확하지 않지만, 높은 혈중 철 농도가 꼭 좋은 뜻이 아니라는 것을 시사하는 결과입니다.   연구팀은 이 데이터를 근거로 건강한 사람이 영양제나 종합 비타민제를 통해 과도한 철분을 섭취할 이유는 없다고 주장했습니다. 어쩌면 높은 철 농도가 조기 사망 위험도를 높일지도 모르기 때문입니다. 그러나 임산부나 빈혈 환자 등 진짜 철분이 필요한 사람들까지 철분 섭취를 꺼릴 필요가 없다는 점도 강조했습니다. 연구 내용은 정상보다 높은 혈중 철농도가 오래 유지되는 경우를 가정한 것으로 본래 철분 부족이 있는 사람을 대상으로 한 것이 아니기 때문입니다. 낮은 철분 농도와 빈혈이 건강에 미치는 악영향은 이미 잘 알려져 있기 때문에 철...

인슐린 주사 일주일에 한 번만 맞아도 된다?

   당뇨병은 관리가 까다로운 만성 질병 중 하나입니다. 특히 인슐린 주사가 필요한 경우에는 더 관리가 어렵습니다. 하루에 주사를 몇 번씩 맞아야 하면 찌르는 것도 고통이고 실수로 건너뛰거나 용량을 실수하는 경우도 드물지 않습니다. 특히 고령 환자의 경우 더 위험할 수 있습니다. 이런 문제를 극복하기 위해 여러 제약 회사들이 새로운 투여 방법과 인슐린 제제를 내놓고 있습니다.   최근 2상 임상 시험을 마친 노보 노디스크 ( Novo Nordisk )의 인슐린 아이코덱 ( icodec )은 일주일에 한 번 투여하는 장시간 인슐린 제제입니다. 아이코덱은 효소에 의해 분해되는 것을 막는 변형 인슐린 분자로 혈액에서 알부민과 결합해 서서히 분리되기 때문에 한 번 주사로도 일주일이나 효과를 유지할 수 있습니다.   하지만 이렇게 장시간 작용하는 인슐린 제제의 경우 환자의 식사나 운동 같은 상황 변화에 인슐린 농도가 적절하게 유지되지 않을 가능성이 있습니다. 이번 2상 임상시험에서는 247명의 당뇨 환자를 두 그룹으로 나눈 후 실험군은 일주일에 한 번씩 아이코덱을 투여받고 매일 위약을 투여받았습니다. 그리고 대조군은 반대로 일주일에 한 번씩 위약을 투여받고 하루에 한 번씩 장시간 인슐린 제제인 란투스 (Lantus, glargine) 100U을 투여받았습니다.   26주에 걸친 임상 실험 결과 하루에 한 번 란투스를 투여받은 그룹이나 일주일에 한 번 아이코덱을 투여받은 그룹에서 특별한 합병증 차이를 발견할 수 없었습니다. 혈당 조절의 지표인 당화 혈색소 (HbA1c) 농도 역시 아이코덱 그룹에서 1.33% 감소한 반면 란투스 그룹에서 1.15% 정도 감소해서 큰 차이는 없었습니다. 그렇다면 하루에 한 번 투여하는 대신 일주일에 한 번 투여하는 것이 더 편리하고 실수로 두 번 투여하거나 건너 뛸 위험성이 적을 것입니다. 이 연구 결과는 뉴잉글랜드 저널 오브 메디슨 ( New England Journal...