기본 콘텐츠로 건너뛰기

R을 이용한 딥러닝 (2)



 앞서 포스트에서 데이터를 잘 만들었다면 이를 저장한 후 다시 불러들이면 되겠지만, 혹시 잘 안되시는 경우를 위해 파일을 별도로 올렸습니다. 압축을 풀면 MNIST_train1.csv, MNIST_test1.csv 두 개의 파일이 나오는데 각각 데이터 갯수를 6000개와 1000개로 줄인 것으로 학습 능력은 그만큼 떨어지는 대신 시간은 훨씬 짧게 걸립니다. 만약 전체 6만개와 1만개 파일을 이용해서 실습을 하는 경우 한 번 돌리는데 몇 시간이 필요한 경우가 생겨 실제로는 예제를 연습하기가 쉽지 않습니다. 그래서 파일을 10% 정도로 줄인 것입니다. 


 일단 파일이 준비되면 H2O 라이브러리를 불러들이고 local H2O를 시작합니다. 자원 할당은 시스템 사양에 따라 달라지겠지만, 저는 컴퓨터 논리 CPU의 절반인 8개를 할당했습니다. 각자 사양에 맞춰 진행하면 될 것 같습니다. 


library(h2o)

localH2O = h2o.init(ip = "localhost", port = 54321, startH2O = TRUE,min_mem_size = "10G",nthreads = 8)

trainfile = "H:/data/deeplearning/MNIST_train1.csv"
train = h2o.importFile(path = trainfile,sep=",")

testfile = "H:/data/deeplearning/MNIST_test1.csv"
test = h2o.importFile(path = testfile,sep=",")


 이제 실제 학습을 진행해 보겠습니다. 


# To see a brief summary of the data, run the following command
summary(train)
summary(test)

y <- span="">
x <- names="" setdiff="" span="" train="" y="">

# We encode the response column as categorical for multinomial
#classification
train[,y] <- as.factor="" span="" train="" y="">
test[,y] <- as.factor="" span="" test="" y="">

# Train a Deep Learning model and valid

  model_cv <- h2o.deeplearning="" x="1:784,</span">
                               y = 785,
                               training_frame = train,
                               activation = "RectifierWithDropout",
                               hidden =  c(800,200,800),
                               input_dropout_ratio = 0.2,
                               l1 = 1e-5,
                               epochs = 200)

  model_cv


 여기서 뉴런은 800/200/800개로 된 딥러닝 모델을 만들었는데, 훈련 자료만 입력해서 일단 학습을 시켜봤습니다. epochs는 몇 회 학습을 할 것인지를 결정하는 옵션으로 hidden의 신경망과 더불어 학습 시간을 좌우하는 중요 옵션이니 잘 활용할 필요가 있습니다. 비슷한 결과라면 당연히 시간이 짧은 편이 유리합니다. 제대로 진행됐다면 아래와 비슷한 결과물이 출력될 것입니다. 





> # Train a Deep Learning model and valid
> 
>   model_cv <- h2o.deeplearning="" x="1:784,</p">
+                                y = 785,
+                                training_frame = train,
+                                activation = "RectifierWithDropout",
+                                hidden =  c(800,200,800),
+                                input_dropout_ratio = 0.2,
+                                l1 = 1e-5,
+                                epochs = 200)
  |===========================================================================================================================================================| 100%
Warning message:
In .h2o.startModelJob(algo, params, h2oRestApiVersion) :
  Dropping bad and constant columns: [x.88, x.87, x.86, x.85, x.84, x.83, x.82, x.760, x.365, x.761, x.762, x.116, x.754, x.755, x.756, x.757, x.758, x.759, x.197, x.110, x.111, x.112, x.113, x.114, x.477, x.115, x.753, x.589, x.505, x.1, x.3, x.2, x.5, x.4, x.7, x.23, x.6, x.22, x.21, x.20, x.141, x.142, x.780, x.29, x.143, x.781, x.28, x.782, x.27, x.783, x.26, x.421, x.784, x.25, x.24, x.776, x.777, x.778, x.779, x.19, x.18, x.253, x.770, x.17, x.771, x.16, x.772, x.15, x.773, x.14, x.774, x.13, x.533, x.775, x.644, x.645, x.646, x.769, x.44, x.281, x.561, x.49, x.169, x.34, x.33, x.32, x.31, x.30, x.393, x.672, x.673, x.674, x.35, x.700, x.701, x.702, x.703, x.309, x.61, x.60, x.225, x.699, x.732, x.337, x.733, x.616, x.617, x.618, x.56, x.55, x.54, x.53, x.52, x.51, x.50, x.59, x.58, x.730, x.57, x.731, x.449, x.726, x.727, x.728, x.729].

> 
>   model_cv
Model Details:
==============

H2ORegressionModel: deeplearning
Model ID:  DeepLearning_model_R_1556977766669_1 
Status of Neuron Layers: predicting y, regression, gaussian distribution, Quadratic loss, 849,801 weights/biases, 9.8 MB, 603,562 training samples, mini-batch size 1
  layer units             type dropout       l1       l2 mean_rate rate_rms momentum mean_weight weight_rms mean_bias bias_rms
1     1   659            Input 20.00 %       NA       NA        NA       NA       NA          NA         NA        NA       NA
2     2   800 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.171791 0.260461 0.000000    0.005984   0.040483  0.213295 0.083011
3     3   200 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.010684 0.010028 0.000000   -0.010907   0.049532  0.918480 0.064619
4     4   800 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.043320 0.028553 0.000000   -0.019463   0.049687  0.373009 0.177849
5     5     1           Linear      NA 0.000010 0.000000  0.002385 0.000937 0.000000    0.000776   0.024837 -0.164671 0.000000


H2ORegressionMetrics: deeplearning
** Reported on training data. **
** Metrics reported on full training frame **

MSE:  0.2040526
RMSE:  0.4517218
MAE:  0.3310534
RMSLE:  0.0947054
Mean Residual Deviance :  0.2040526


 
 이 경우 모델에 대해서 주는 정보가 앞서 봤던 지표인 MSE. RMSE 이외에 MAE (mean absolute error)와 RMSLE (root mean squared log error)가 있는데 당연히 이것이 작을 수록 에러가 적다는 의미이기 때문에 더 좋은 모델이 됩니다. 참고로 위의 수치는 시드값을 주지 않는 이상 할 때마다 조금씩 달라질 수 있다는 점을 알아야 합니다. DNN 역시 우리와 마찬가지로 공부할 때마다 조금씩 다른 결과를 보여줄 수 있습니다. 비록 거의 비슷하긴 하지만 말이죠. 여기서 뉴런을 더 딥하게 만들어 4개의 층을 만들어 보겠습니다. 


 참고로 웹브라우저 상에서도 http://localhost:54321로 결과를 볼 수 있습니다. getmodel로 들어가 모델들을 확인할 수 있습니다. 






> model_cv <- h2o.deeplearning="" x="1:784,</p">
+                                y = 785,
+                                training_frame = train,
+                                activation = "RectifierWithDropout",
+                                hidden =  c(800,200,200,800),
+                                input_dropout_ratio = 0.2,
+                                l1 = 1e-5,
+                                epochs = 200)
  |===========================================================================================================================================================| 100%
Warning message:
In .h2o.startModelJob(algo, params, h2oRestApiVersion) :
  Dropping bad and constant columns: [x.88, x.87, x.86, x.85, x.84, x.83, x.82, x.760, x.365, x.761, x.762, x.116, x.754, x.755, x.756, x.757, x.758, x.759, x.197, x.110, x.111, x.112, x.113, x.114, x.477, x.115, x.753, x.589, x.505, x.1, x.3, x.2, x.5, x.4, x.7, x.23, x.6, x.22, x.21, x.20, x.141, x.142, x.780, x.29, x.143, x.781, x.28, x.782, x.27, x.783, x.26, x.421, x.784, x.25, x.24, x.776, x.777, x.778, x.779, x.19, x.18, x.253, x.770, x.17, x.771, x.16, x.772, x.15, x.773, x.14, x.774, x.13, x.533, x.775, x.644, x.645, x.646, x.769, x.44, x.281, x.561, x.49, x.169, x.34, x.33, x.32, x.31, x.30, x.393, x.672, x.673, x.674, x.35, x.700, x.701, x.702, x.703, x.309, x.61, x.60, x.225, x.699, x.732, x.337, x.733, x.616, x.617, x.618, x.56, x.55, x.54, x.53, x.52, x.51, x.50, x.59, x.58, x.730, x.57, x.731, x.449, x.726, x.727, x.728, x.729].

> 
>   model_cv
Model Details:
==============

H2ORegressionModel: deeplearning
Model ID:  DeepLearning_model_R_1556977766669_2 
Status of Neuron Layers: predicting y, regression, gaussian distribution, Quadratic loss, 890,001 weights/biases, 10.3 MB, 601,758 training samples, mini-batch size 1
  layer units             type dropout       l1       l2 mean_rate rate_rms momentum mean_weight weight_rms mean_bias bias_rms
1     1   659            Input 20.00 %       NA       NA        NA       NA       NA          NA         NA        NA       NA
2     2   800 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.144651 0.231371 0.000000    0.006540   0.039000  0.307433 0.061740
3     3   200 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.008937 0.007291 0.000000   -0.008280   0.049811  0.952130 0.041575
4     4   200 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.015841 0.013679 0.000000   -0.018627   0.072190  0.737129 0.079147
5     5   800 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.069895 0.045053 0.000000   -0.022287   0.048712  0.720120 0.096289
6     6     1           Linear      NA 0.000010 0.000000  0.001392 0.000391 0.000000   -0.002196   0.015756  0.215260 0.000000


H2ORegressionMetrics: deeplearning
** Reported on training data. **
** Metrics reported on full training frame **

MSE:  0.2291781
RMSE:  0.4787255
MAE:  0.3190679
RMSLE:  0.1753631
Mean Residual Deviance :  0.2291781


 
 MSE/RMSE/MAE/RMSLE를 보면 오히려 약간 늘어났다는 사실을 알 수 있습니다. 더 깊은 모델이 더 좋은 결과를 보여주지 않은 것이죠. 더 얕은 모델은 어떨까요? 


> model_cv <- h2o.deeplearning="" x="1:784,</p">
+                                y = 785,
+                                training_frame = train,
+                                activation = "RectifierWithDropout",
+                                hidden =  c(800,800),
+                                input_dropout_ratio = 0.2,
+                                l1 = 1e-5,
+                                epochs = 200)
  |===========================================================================================================================================================| 100%
Warning message:
In .h2o.startModelJob(algo, params, h2oRestApiVersion) :
  Dropping bad and constant columns: [x.88, x.87, x.86, x.85, x.84, x.83, x.82, x.760, x.365, x.761, x.762, x.116, x.754, x.755, x.756, x.757, x.758, x.759, x.197, x.110, x.111, x.112, x.113, x.114, x.477, x.115, x.753, x.589, x.505, x.1, x.3, x.2, x.5, x.4, x.7, x.23, x.6, x.22, x.21, x.20, x.141, x.142, x.780, x.29, x.143, x.781, x.28, x.782, x.27, x.783, x.26, x.421, x.784, x.25, x.24, x.776, x.777, x.778, x.779, x.19, x.18, x.253, x.770, x.17, x.771, x.16, x.772, x.15, x.773, x.14, x.774, x.13, x.533, x.775, x.644, x.645, x.646, x.769, x.44, x.281, x.561, x.49, x.169, x.34, x.33, x.32, x.31, x.30, x.393, x.672, x.673, x.674, x.35, x.700, x.701, x.702, x.703, x.309, x.61, x.60, x.225, x.699, x.732, x.337, x.733, x.616, x.617, x.618, x.56, x.55, x.54, x.53, x.52, x.51, x.50, x.59, x.58, x.730, x.57, x.731, x.449, x.726, x.727, x.728, x.729].

> 
>   model_cv
Model Details:
==============

H2ORegressionModel: deeplearning
Model ID:  DeepLearning_model_R_1556977766669_3 
Status of Neuron Layers: predicting y, regression, gaussian distribution, Quadratic loss, 1,169,601 weights/biases, 13.5 MB, 768,000 training samples, mini-batch size 1
  layer units             type dropout       l1       l2 mean_rate rate_rms momentum mean_weight weight_rms mean_bias bias_rms
1     1   659            Input 20.00 %       NA       NA        NA       NA       NA          NA         NA        NA       NA
2     2   800 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.166924 0.257318 0.000000    0.006099   0.043079  0.036390 0.085338
3     3   800 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.029768 0.020146 0.000000   -0.010178   0.041947  0.977375 0.076209
4     4     1           Linear      NA 0.000010 0.000000  0.000833 0.000401 0.000000   -0.000158   0.023762  0.112036 0.000000


H2ORegressionMetrics: deeplearning
** Reported on training data. **
** Metrics reported on full training frame **

MSE:  0.206431
RMSE:  0.4543467
MAE:  0.315353
RMSLE:  NaN
Mean Residual Deviance :  0.206431


 생각보다 큰 차이가 있지는 않습니다. 여기서 epoch를 늘려보면 어떨까요?  


> model_cv <- h2o.deeplearning="" x="1:784,</p">
+                                y = 785,
+                                training_frame = train,
+                                activation = "RectifierWithDropout",
+                                hidden =  c(800,800),
+                                input_dropout_ratio = 0.2,
+                                l1 = 1e-5,
+                                epochs = 300)
  |===========================================================================================================================================================| 100%
Warning message:
In .h2o.startModelJob(algo, params, h2oRestApiVersion) :
  Dropping bad and constant columns: [x.88, x.87, x.86, x.85, x.84, x.83, x.82, x.760, x.365, x.761, x.762, x.116, x.754, x.755, x.756, x.757, x.758, x.759, x.197, x.110, x.111, x.112, x.113, x.114, x.477, x.115, x.753, x.589, x.505, x.1, x.3, x.2, x.5, x.4, x.7, x.23, x.6, x.22, x.21, x.20, x.141, x.142, x.780, x.29, x.143, x.781, x.28, x.782, x.27, x.783, x.26, x.421, x.784, x.25, x.24, x.776, x.777, x.778, x.779, x.19, x.18, x.253, x.770, x.17, x.771, x.16, x.772, x.15, x.773, x.14, x.774, x.13, x.533, x.775, x.644, x.645, x.646, x.769, x.44, x.281, x.561, x.49, x.169, x.34, x.33, x.32, x.31, x.30, x.393, x.672, x.673, x.674, x.35, x.700, x.701, x.702, x.703, x.309, x.61, x.60, x.225, x.699, x.732, x.337, x.733, x.616, x.617, x.618, x.56, x.55, x.54, x.53, x.52, x.51, x.50, x.59, x.58, x.730, x.57, x.731, x.449, x.726, x.727, x.728, x.729].

> 
>   model_cv
Model Details:
==============

H2ORegressionModel: deeplearning
Model ID:  DeepLearning_model_R_1556977766669_4 
Status of Neuron Layers: predicting y, regression, gaussian distribution, Quadratic loss, 1,169,601 weights/biases, 13.5 MB, 1,072,201 training samples, mini-batch size 1
  layer units             type dropout       l1       l2 mean_rate rate_rms momentum mean_weight weight_rms mean_bias bias_rms
1     1   659            Input 20.00 %       NA       NA        NA       NA       NA          NA         NA        NA       NA
2     2   800 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.183996 0.275787 0.000000    0.005372   0.042287 -0.121058 0.098303
3     3   800 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.033856 0.020338 0.000000   -0.011571   0.044719  0.998392 0.103063
4     4     1           Linear      NA 0.000010 0.000000  0.000928 0.000425 0.000000    0.000717   0.024313  0.107939 0.000000


H2ORegressionMetrics: deeplearning
** Reported on training data. **
** Metrics reported on full training frame **

MSE:  0.3171086
RMSE:  0.5631239
MAE:  0.4387138
RMSLE:  NaN
Mean Residual Deviance :  0.3171086

 

 되려 별로 결과가 좋지 않습니다. 이번에는 오토인코더와 비슷한 모델을 사용해보겠습니다. 기본적인 아이디어는 모래 시계처럼 중간이 잘록한 형태의 신경망을 만들어 입력 신호를 다시 복원하는 것입니다. 여기서는 400/200/2/200/400의 신경망을 만들어 보겠습니다. 

# autoencoder


> model_cv <- h2o.deeplearning="" x="1:784,</p">
+                                y = 785,
+                                training_frame = train,
+                                activation = "RectifierWithDropout",
+                                hidden =  c(400, 200, 2, 200, 400),
+                                input_dropout_ratio = 0.2,
+                                l1 = 1e-5,
+                                epochs = 200)
  |===========================================================================================================================================================| 100%
Warning message:
In .h2o.startModelJob(algo, params, h2oRestApiVersion) :
  Dropping bad and constant columns: [x.88, x.87, x.86, x.85, x.84, x.83, x.82, x.760, x.365, x.761, x.762, x.116, x.754, x.755, x.756, x.757, x.758, x.759, x.197, x.110, x.111, x.112, x.113, x.114, x.477, x.115, x.753, x.589, x.505, x.1, x.3, x.2, x.5, x.4, x.7, x.23, x.6, x.22, x.21, x.20, x.141, x.142, x.780, x.29, x.143, x.781, x.28, x.782, x.27, x.783, x.26, x.421, x.784, x.25, x.24, x.776, x.777, x.778, x.779, x.19, x.18, x.253, x.770, x.17, x.771, x.16, x.772, x.15, x.773, x.14, x.774, x.13, x.533, x.775, x.644, x.645, x.646, x.769, x.44, x.281, x.561, x.49, x.169, x.34, x.33, x.32, x.31, x.30, x.393, x.672, x.673, x.674, x.35, x.700, x.701, x.702, x.703, x.309, x.61, x.60, x.225, x.699, x.732, x.337, x.733, x.616, x.617, x.618, x.56, x.55, x.54, x.53, x.52, x.51, x.50, x.59, x.58, x.730, x.57, x.731, x.449, x.726, x.727, x.728, x.729].

> 
>   model_cv
Model Details:
==============

H2ORegressionModel: deeplearning
Model ID:  DeepLearning_model_R_1556977766669_5 
Status of Neuron Layers: predicting y, regression, gaussian distribution, Quadratic loss, 426,003 weights/biases, 5.0 MB, 1,080,000 training samples, mini-batch size 1
  layer units             type dropout       l1       l2 mean_rate rate_rms momentum mean_weight weight_rms mean_bias bias_rms
1     1   659            Input 20.00 %       NA       NA        NA       NA       NA          NA         NA        NA       NA
2     2   400 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.117370 0.212231 0.000000    0.010417   0.054571  0.119259 0.110808
3     3   200 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.009224 0.009703 0.000000   -0.018213   0.067514  1.006075 0.091013
4     4     2 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.001595 0.001157 0.000000    0.017373   0.141770  1.912306 0.232235
5     5   200 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.041396 0.188829 0.000000   -0.145912   0.147096  0.834432 0.844081
6     6   400 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.080982 0.110674 0.000000   -0.029381   0.073252  0.869751 0.098928
7     7     1           Linear      NA 0.000010 0.000000  0.002397 0.001085 0.000000    0.005996   0.029974 -0.073048 0.000000


H2ORegressionMetrics: deeplearning
** Reported on training data. **
** Metrics reported on full training frame **

MSE:  2.45604
RMSE:  1.567176
MAE:  1.434909
RMSLE:  0.475296
Mean Residual Deviance :  2.45604


 되려 훨씬 좋지 않은 결과가 나왔습니다. epoch를 600으로 늘리면 이것보다는 좋지만 그래도 여전히 좋지 않은 결과가 나옵니다.  


> model_cv <- h2o.deeplearning="" x="1:784,</p">
+                                y = 785,
+                                training_frame = train,
+                                activation = "RectifierWithDropout",
+                                hidden =  c(400, 200, 2, 200, 400),
+                                input_dropout_ratio = 0.2,
+                                l1 = 1e-5,
+                                epochs = 600)
  |===========================================================================================================================================================| 100%
Warning message:
In .h2o.startModelJob(algo, params, h2oRestApiVersion) :
  Dropping bad and constant columns: [x.88, x.87, x.86, x.85, x.84, x.83, x.82, x.760, x.365, x.761, x.762, x.116, x.754, x.755, x.756, x.757, x.758, x.759, x.197, x.110, x.111, x.112, x.113, x.114, x.477, x.115, x.753, x.589, x.505, x.1, x.3, x.2, x.5, x.4, x.7, x.23, x.6, x.22, x.21, x.20, x.141, x.142, x.780, x.29, x.143, x.781, x.28, x.782, x.27, x.783, x.26, x.421, x.784, x.25, x.24, x.776, x.777, x.778, x.779, x.19, x.18, x.253, x.770, x.17, x.771, x.16, x.772, x.15, x.773, x.14, x.774, x.13, x.533, x.775, x.644, x.645, x.646, x.769, x.44, x.281, x.561, x.49, x.169, x.34, x.33, x.32, x.31, x.30, x.393, x.672, x.673, x.674, x.35, x.700, x.701, x.702, x.703, x.309, x.61, x.60, x.225, x.699, x.732, x.337, x.733, x.616, x.617, x.618, x.56, x.55, x.54, x.53, x.52, x.51, x.50, x.59, x.58, x.730, x.57, x.731, x.449, x.726, x.727, x.728, x.729].

> 
>   model_cv
Model Details:
==============

H2ORegressionModel: deeplearning
Model ID:  DeepLearning_model_R_1556977766669_6 
Status of Neuron Layers: predicting y, regression, gaussian distribution, Quadratic loss, 426,003 weights/biases, 5.0 MB, 640,914 training samples, mini-batch size 1
  layer units             type dropout       l1       l2 mean_rate rate_rms momentum mean_weight weight_rms mean_bias bias_rms
1     1   659            Input 20.00 %       NA       NA        NA       NA       NA          NA         NA        NA       NA
2     2   400 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.100174 0.195964 0.000000    0.009572   0.052189  0.287158 0.102086
3     3   200 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.010017 0.014022 0.000000   -0.013692   0.068543  0.989972 0.060553
4     4     2 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.001219 0.000811 0.000000    0.021628   0.123249  1.747016 0.023651
5     5   200 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.004834 0.002778 0.000000   -0.116279   0.121237  0.857649 0.158484
6     6   400 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.049192 0.040026 0.000000   -0.023362   0.069099  0.899582 0.065283
7     7     1           Linear      NA 0.000010 0.000000  0.001488 0.000682 0.000000   -0.004557   0.027621  0.071537 0.000000


H2ORegressionMetrics: deeplearning
** Reported on training data. **
** Metrics reported on full training frame **

MSE:  1.984534
RMSE:  1.408735
MAE:  1.230678
RMSLE:  0.3468884
Mean Residual Deviance :  1.984534


 여러 가지 방법으로 모델을 만들고 비교할 수 있지만, autoML 같은 방법을 쓸 경우 데이터의 양이 많고 신경망의 갯수가 많을 수밖에 없어 상당한 시간이 필요하게 됩니다. 아무튼 H2O를 통해 간단한 딥러닝 모델을 구현해 봤습니다. 


 참고로 1000/100/1000 으로 모델을 만들어 보니 생각보다 좋은 결과가 나왔습니다. 시간도 아주 길지 않아서 괜찮은 듯 합니다. 다음에 계속해 보겠습니다. 


> model_cv <- h2o.deeplearning="" x="1:784,</span">
+                                y = 785,
+                                training_frame = train,
+                                activation = "RectifierWithDropout",
+                                hidden =  c(1000,100,1000),
+                                input_dropout_ratio = 0.2,
+                                l1 = 1e-5,
+                                epochs = 600)
  |============================================================================================================================================================| 100%


> 
>   model_cv
Model Details:
==============

H2ORegressionModel: deeplearning
Model ID:  DeepLearning_model_R_1557063486636_5 
Status of Neuron Layers: predicting y, regression, gaussian distribution, Quadratic loss, 862,101 weights/biases, 10.0 MB, 1,001,489 training samples, mini-batch size 1
  layer units             type dropout       l1       l2 mean_rate rate_rms momentum mean_weight weight_rms mean_bias bias_rms
1     1   659            Input 20.00 %       NA       NA        NA       NA       NA          NA         NA        NA       NA
2     2  1000 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.177852 0.258550 0.000000    0.005795   0.036106  0.138419 0.094516
3     3   100 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.006789 0.007701 0.000000   -0.010645   0.049678  0.909954 0.070663
4     4  1000 RectifierDropout 50.00 % 0.000010 0.000000  0.033034 0.025869 0.000000   -0.028907   0.050627  0.211962 0.141360
5     5     1           Linear      NA 0.000010 0.000000  0.004257 0.001843 0.000000    0.006635   0.029327 -0.483303 0.000000


H2ORegressionMetrics: deeplearning
** Reported on training data. **
** Metrics reported on full training frame **

MSE:  0.07880728
RMSE:  0.2807264
MAE:  0.1910654
RMSLE:  0.08748502


Mean Residual Deviance :  0.07880728

댓글

이 블로그의 인기 게시물

중등도 코로나 19 환자에서 제한적인 효과만을 확인한 렘데시비르

   현재 렘데시비르는 인공 호흡기 치료가 필요한 환자 등 중증 코로나 19 환자의 치료제로 사용되고 있습니다. 다만 공급이 부족해서 갑자가 중증 코로나 19 환자가 늘어날 경우 수급 문제가 불거질 수밖에 없습니다. 따라서 이를 중등도 코로나 19 환자 (경증이나 무증상은 당연히 치료가 필요없거나 대증 요법 정도) 사용한다는 것은 지금 당장에 급한 연구는 아니지만, 나중에 수급량이 많아지고 가격이 낮아질 때를 생각하면 의미 있는 연구 결과입니다.   렘데시비르 제조사인 길리어드 사이언스의 다아애나 브레이너드 박사 ( Dr. Diana Brainard of Gilead Sciences )는 병원에 입원이 필요했던 중등도 코로나 19 환자 584명을 렘데시비르 5일, 10일 투여 실험군과 위약을 투여한 대조군으로 나눠 임상 경과, 사망 등 중요한 합병증 발생 등에서 차이를 보이는지 조사했습니다. 연구 대상자의 40% 이상은 당뇨 같은 만성 질환이 있었으며 평균 연령은 57세였습니다.   연구 결과 대조군의 2%, 5일 투여군의 2%, 10일 투여군의 1%가 사망했으나 사망자 수가 4명, 3명, 2명 정도로 통계적 차이를 판단하기에는 사망자 수가 적어 결론을 내리기 어려웠습니다. 연구팀은 5일 투여군에서 임상 경과가 다소 호전되는 것을 판단했으나 10일 투여군에서는 통계적 차이를 검증할 수 없었습니다. 결론적으로 말해 중등도 코로나 19 환자에서 렘데시비르 투여는 확실한 임상적 이득이 없었습니다.     5일 투여량만 해도 가격이 3120달러라는 점을 감안할 때 중등도 환자에서 렘데시비르 투여는 설령 공급이 원활하다고 해도 적절한 치료법이 아닌 것으로 판단됩니다. 더구나 지금처럼 공급이 불안해 중증 환자 투여 물량 확보가 아쉬운 상황에서는 말할 것도 없습니다.  이번 연구는 렘데시비르보다 효과가 뛰어나면서 저렴한 차세대 항바이러스 치료제의 필요성을 다시 보여준 것으로 생각됩니다....

코로나 19 감염 위험성이 큰 동물은?

  ( A new genomic study ranks the potential of the SARS-CoV-2 spike protein to bind to the ACE2 receptor site in 410 vertebrate animals. Old World primates and great apes, which have identical amino acids at the binding site as humans, are predicted to have a very high propensity for binding ACE2 and are likely susceptible to SARS-CoV-2 infection. Credit: Matt Verdolivo/UC Davis )    코로나 19를 일으키는  SARS-CoV-2는 사스 및 메르스와 마찬가지로 박쥐를 자연 숙주로 삼는 베타 코로나바이러스 계통입니다. 따라서 본래 박쥐에 살던 바이러스가 중간 단계를 거쳐 사람으로 넘어온 것으로 추정됩니다. 그런데 이 이야기는 SARS-CoV-2 역시 사람에만 감염되는 것이 아니라 종을 넘어 다른 포유류나 조류, 혹은 척추동물에 감염될 수 있음을 시사합니다. 코로나 바이러스가 침투하는 경로인 ACE2 수용체는 다른 척추동물에서도 볼 수 있기 때문입니다. 다만 SARS-CoV-2와 ACE2 수용체의 결합 수준은 동물마다 큰 차이가 있어 감염 위험도는 모두 다를 수밖에 없습니다.   캘리포니아 대학 데이비스 캠퍼스 (UC Davis)의 조안나 다마스 (Joana Damas)와 그 동료들은 410종의 척추동물에서 ACE2 수용체 유전자를 조사해 코로나 19 감염 위험도를 조사했습니다. 연구팀에 따르면 ACE2 수용체 전체가 아니라 25개의 아미노산 배열이 특히 결합력에 큰 영향을 미쳐 감염 가능성을 결정합니다.   연구 결과 쉽게 예상할 수 있듯이 사람과 가까운 침팬치, 고릴라, 보노보...

178Tb/s - 광섬유 통신 신기록 수립

  ( Lidia Galdino, lead researcher on the study. Credit: James Tye / UCL )  현재 가정에 들어오는 초고속 광통신은 10Gb/s 정도가 가장 빠른 편입니다. 그러나 사실 광섬유를 통해서 보낼 수 있는 정보량은 이것보다 훨씬 많습니다. 현재 개발 중인 기술 가운데서는 이미 1Tb/s 이상이 속도를 지닌 것들이 많아 미래에는 테라 인터넷 시대가 가능할 것으로 예상됩니다. 그런 가운데 영국 유니버시티 칼리지 런던 (UCL)의 리디아 갈디노( Lidia Galdino )가 이끄는 연구팀이 178Tb/s라는 신기록을 세웠다는 소식입니다.   광섬유 통신을 위한 주파수는 4.5THz까지 높일 수 있습니다. 최근에 개발된 신기술은 9THz 벽도 돌파했습니다. 그러나 연구팀은 16.8THz라는 새로운 영역에 도달했습니다. 주파수가 높을 수록 더 많은 정보를 전송할 수 있습니다. 하지만 16.8THz의 주파수로도 178Tb/s의 데이터 전송 속도는 사실 불가능합니다. 연구팀은  Geometric Shaping (GS) 방식으로 레이저 신호의 페이즈, 밝기, 편광 수준을 조절해 여러 신호가 서로 간섭 없이 전달되게 만들어 이런 신기록을 수립했습니다.   물론 새로운 기술이 항상 그렇듯이 바로 상용화가 가능한 것은 아닙니다. 특히 광섬유는 장거리 정보 전송이 가능해야 할 뿐 아니라 오류 없이 장시간 작동이 가능해야 합니다. 자꾸 에러가 생기거나 고장난다면 아무리 속도가 빨라도 무용지물입니다. 이 단계를 극복하고 경제성까지 갖춰 실용화 되는 경우는 사실 소수에 지나지 않습니다.   하지만 경쟁적으로 Tb 급 대역폭을 지닌 광통신 기술이 개발되고 있어 테라바이트 급 정보도 순식간에 전송할 수 있는 시대가 올 것은 분명합니다. 과거 전화선을 이용한 56K 모뎀에서 지금의 광섬유 기반 초고속 인터넷이 온 것처럼 속도는 계속 빨라질 수밖에 없기 때문입니다...