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R을 이용해 간단한 신경망 만들기 (16)





 점점 인공지능 관련 포스팅이 복잡해지고 있어서 간단한 신경망 만들기는 아마도 이번까지 하고 다음부터는 로지스틱 회귀 분석을 진행하면서 R을 이용한 딥러닝으로 해야 할 것 같습니다. 아무튼 H2O 패키지는 상업용 인공지능 툴 답게 여러 가지 기능을 제공하는데, 그 중 흥미로운 것 가운데 하나가 바로 AutoML 기능입니다. 


 앞서 살펴본 것과 같이 인공 신경망에는 여러 가지 옵션이 존재하며 이 옵션을 어떻게 조정하는지에 따라 다른 결과가 나오게 됩니다. 최적의 결과를 얻기 위해서는 여러 번의 시행 착오를 거쳐야만 하는데, 상당히 많은 시간과 노력을 소모하게 됩니다. 따라서 여러 가지 모델을 테스트하고 이를 비교해서 최적 모델을 찾는 과정도 자동화할 수 있는 기법이 개발되었습니다. H2O의 AutoML 이 바로 그런 기능으로 딥러닝은 물론 랜덤 포레스트나 GBMs (Gradient Boosting Machines), Stacked Ensemble 같은 인공 지능 기법을 이용한 모델을 제시합니다. H2O.ai 에서 제시한 예제를 살펴보겠습니다. 


#autoML

library(h2o)

localH2O = h2o.init()

# Import a sample binary outcome train/test set into H2O
train <- a="" class="con_link" h2o.importfile="" href="https://s3.amazonaws.com/erin-data/higgs/higgs_train_10k.csv" style="overflow-wrap: break-word; text-decoration-line: none;" target="_blank">https://s3.amazonaws.com/erin-data/higgs/higgs_train_10k.csv
")
test <- a="" class="con_link" h2o.importfile="" href="https://s3.amazonaws.com/erin-data/higgs/higgs_test_5k.csv" style="overflow-wrap: break-word; text-decoration-line: none;" target="_blank">https://s3.amazonaws.com/erin-data/higgs/higgs_test_5k.csv
")

# Identify predictors and response
y <- response="" span="">
x <- names="" setdiff="" span="" train="" y="">

# For binary classification, response should be a factor
train[,y] <- as.factor="" span="" train="" y="">
test[,y] <- as.factor="" span="" test="" y="">

# Run AutoML for 20 base models (limited to 1 hour max runtime by default)
aml <- h2o.automl="" x="x," y="y,</span">
                  training_frame = train,
                  max_models = 20,
                  seed = 1)

# View the AutoML Leaderboard
lb <- aml="" leaderboard="" span="">
print(lb, n = nrow(lb))  # Print all rows instead of default (6 rows)

# The leader model is stored here
aml@leader

# If you need to generate predictions on a test set, you can make
# predictions directly on the `"H2OAutoML"` object, or on the leader
# model object directly

pred <- also="" aml="" h2o.predict="" nbsp="" predict="" span="" test="" works="">

pred


 이 예제는 테스트에 상당한 시간이 걸립니다. 논리 CPU 8개를 할당해도 20분 이상 걸리니 참고하시기 바랍니다. 아무튼 아래와 같은 결과를 얻을 수 있습니다. 




> print(lb, n = nrow(lb))  # Print all rows instead of default (6 rows)
                                              model_id       auc   logloss mean_per_class_error      rmse       mse
1     StackedEnsemble_AllModels_AutoML_20190324_225820 0.7890978 0.5524149            0.3196844 0.4326267 0.1871658
2  StackedEnsemble_BestOfFamily_AutoML_20190324_225820 0.7854526 0.5561179            0.3255787 0.4343390 0.1886503
3                         GBM_5_AutoML_20190324_225820 0.7808367 0.5599029            0.3408479 0.4361915 0.1902630
4                         GBM_2_AutoML_20190324_225820 0.7800364 0.5598060            0.3399258 0.4364149 0.1904580
5                         GBM_1_AutoML_20190324_225820 0.7798268 0.5608570            0.3350957 0.4366159 0.1906335
6                         GBM_3_AutoML_20190324_225820 0.7786685 0.5617903            0.3255378 0.4371886 0.1911339
7            GBM_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_4 0.7777929 0.6275684            0.3187812 0.4667522 0.2178576
8            GBM_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_1 0.7772185 0.6008910            0.3227162 0.4535716 0.2057272
9                         GBM_4_AutoML_20190324_225820 0.7714230 0.5697120            0.3374203 0.4410703 0.1945430
10           GBM_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_2 0.7698263 0.6070157            0.3072613 0.4566813 0.2085578
11                        DRF_1_AutoML_20190324_225820 0.7428924 0.5958832            0.3554027 0.4527742 0.2050045
12                        XRT_1_AutoML_20190324_225820 0.7420910 0.5993457            0.3565826 0.4531168 0.2053148
13  DeepLearning_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_5 0.7351121 0.6072728            0.3589475 0.4570660 0.2089094
14           GBM_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_3 0.7279124 0.6889933            0.3598375 0.4763117 0.2268729
15           GBM_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_5 0.7167078 0.6865927            0.3871737 0.4967212 0.2467320
16               DeepLearning_1_AutoML_20190324_225820 0.7041353 0.6277710            0.3983563 0.4669145 0.2180092
17  DeepLearning_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_1 0.6959598 0.7166216            0.3989566 0.4849767 0.2352024
18  DeepLearning_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_4 0.6945008 0.7056079            0.4041671 0.4878114 0.2379600
19           GLM_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_1 0.6826524 0.6385205            0.3972341 0.4726827 0.2234290
20  DeepLearning_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_3 0.6807204 0.6708166            0.4045776 0.4810438 0.2314031
21  DeepLearning_grid_1_AutoML_20190324_225820_model_2 0.6801893 0.7273539            0.4073531 0.4926833 0.2427368


 이 결과를 보면 1번에 StackedEnsemble_AllModels_AutoML_20190324_225820 모델이 가장 좋은 결과를 얻었습니다. 아래에서 이 모델에 대한 더 상세한 정보가 나옵니다. 


> # The leader model is stored here
> aml@leader
Model Details:
==============

H2OBinomialModel: stackedensemble
Model ID:  StackedEnsemble_AllModels_AutoML_20190324_225820 
NULL


H2OBinomialMetrics: stackedensemble
** Reported on training data. **

MSE:  0.1049423
RMSE:  0.323948
LogLoss:  0.3599495
Mean Per-Class Error:  0.1240032
AUC:  0.9527414
pr_auc:  0.9548414
Gini:  0.9054828

Confusion Matrix (vertical: actual; across: predicted) for F1-optimal threshold:
          0    1    Error         Rate
0      3906  799 0.169819    =799/4705
1       414 4881 0.078187    =414/5295
Totals 4320 5680 0.121300  =1213/10000

Maximum Metrics: Maximum metrics at their respective thresholds
                        metric threshold    value idx
1                       max f1  0.488791 0.889476 208
2                       max f2  0.369647 0.931987 253
3                 max f0point5  0.616275 0.897052 160
4                 max accuracy  0.517914 0.879400 197
5                max precision  0.948386 1.000000   0
6                   max recall  0.171604 1.000000 346
7              max specificity  0.948386 1.000000   0
8             max absolute_mcc  0.514976 0.757984 198
9   max min_per_class_accuracy  0.551951 0.877620 185
10 max mean_per_class_accuracy  0.536136 0.878565 190

Gains/Lift Table: Extract with `h2o.gainsLift(, )` or `h2o.gainsLift(, valid=, xval=)`

H2OBinomialMetrics: stackedensemble
** Reported on cross-validation data. **
** 5-fold cross-validation on training data (Metrics computed for combined holdout predictions) **

MSE:  0.1871658
RMSE:  0.4326267
LogLoss:  0.5524149
Mean Per-Class Error:  0.3196844
AUC:  0.7890978
pr_auc:  0.8047692
Gini:  0.5781957

Confusion Matrix (vertical: actual; across: predicted) for F1-optimal threshold:
          0    1    Error         Rate
0      2301 2404 0.510946   =2404/4705
1       680 4615 0.128423    =680/5295
Totals 2981 7019 0.308400  =3084/10000

Maximum Metrics: Maximum metrics at their respective thresholds
                        metric threshold    value idx
1                       max f1  0.350203 0.749553 274
2                       max f2  0.179339 0.860131 348
3                 max f0point5  0.614417 0.738955 156
4                 max accuracy  0.518482 0.713400 198
5                max precision  0.948036 1.000000   0
6                   max recall  0.067843 1.000000 393
7              max specificity  0.948036 1.000000   0
8             max absolute_mcc  0.535747 0.425420 190
9   max min_per_class_accuracy  0.531468 0.712181 192
10 max mean_per_class_accuracy  0.535747 0.713052 190

Gains/Lift Table: Extract with `h2o.gainsLift(, )` or `h2o.gainsLift(, valid=, xval=)`


 이 베스트 모델은 aml@leader에 저장되어 있으며 다른 모델을 지정하는 방법은 h2o.getModel()을 통해 가능합니다. 모델을 저장하는 방법은 h2o.saveModel()를 사용합니다 .이 때 경로도 같이 정해주어야 합니다. 



# save the model
model_path <- force="TRUE)</span" h2o.savemodel="" object="model," path="getwd(),">


# load the model
saved_model <- h2o.loadmodel="" model_path="" span="">



 참고 



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