바이러스로 세균을 퇴치한다?

(Let's give our special "phage" attack to those evil C. difficile. Credit: Satoshi Uematsu, Osaka City University)

현재 세계는 코로나 19라는 전례 없는 바이러스 팬데믹에 신음하고 있습니다. 많은 사람들의 관심이 이 치명적인 바이러스 질환의 전파를 막고 궁극적으로는 정복하는데 있습니다. 하지만 사실 바이러스는 순수악이 아니라 그냥 자연적으로 세포의 자원을 가로채 살아가는 생물학적 기계일 뿐입니다. 사실 사람에게 도움 되는 기계이기도 합니다. 세포 내에 유전자를 전달하는 데 유용한 특징 덕분에 많은 바이러스가 유전자 연구에 사용되고 있습니다.

바이러스 가운데 박테리아를 파괴하는 박테리오파지(Bacteriophage)는 이전부터 항생제를 대신하거나 보조할 수 있는 세균 치료제로 관심을 받고 있습니다. 오사카 시립 대학과 도쿄 대학(Osaka City University and The Institute for Medical Science, The University of Tokyo)의 연구팀은 101명의 건강한 일본인에서 대변 샘플의 메타지놈 (Metagenome) 분석을 통해 장내 박테리아와 이를 공격하는 파지에 대한 데이터를 확보했습니다.

이 가운데 가장 흥미로운 것은 장내에서 흔히 발견되면서도 종종 문제를 일으키는 세균인 클로스트리디움 디피실 (Clostridium difficile)을 잡아먹는 파지입니다. 클로스트리디움 디피실은 특히 항생제 사용 후 장내 세균 환경이 달라졌을 때 이상 증식해 장염을 일으키는 고약한 세균으로 심한 경우 생명에 심각한 위험을 일으킵니다. 항생제 내성도 만만치 않은 세균으로 이를 파괴하는 바이러스를 약물처럼 사용할 수 있다면 많은 생명을 살릴 수 있을지도 모릅니다.

연구팀은 이 파지가 박테리아를 파괴하는 효소를 확인했으며 쥐를 이용한 동물 모델에서 실제로 세균을 파괴하는 것을 확인할 수 있었습니다. 물론 바이러스라는 것은 쉽게 변이를 일으키며 어디로 튈지 모르는 위험한 존재라 함부로 다뤄서는 안되지만, 항생제 내성균도 쉽게 파괴할 수 있는 무기로 관심을 받고 있는 것도 사실입니다. 바이러스 자체가 아니라도 세균 표면에 구멍을 뚫거나 녹이는 효소를 활용한다면 새로운 치료제 개발에 도움을 주지 않을까 기대합니다.

참고

https://phys.org/news/2020-07-viral-dark-exposed-metagenome-database.html

Cell Host & Microbe (2020). DOI: 10.1016/j.chom.2020.06.005

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통계 공부는 어떻게 하는 것이 좋을까?

사실 저도 통계 전문가가 아니기 때문에 이런 주제로 글을 쓰기가 다소 애매하지만, 그래도 누군가에게 도움이 될 수 있다고 생각해서 글을 올려봅니다. 통계학, 특히 수학적인 의미에서의 통계학을 공부하게 되는 계기는 사람마다 다르긴 하겠지만, 아마도 비교적 흔하고 난감한 경우는 논문을 써야 하는 경우일 것입니다. 오늘날의 학문적 연구는 집단간 혹은 방법간의 차이가 있다는 것을 객관적으로 보여줘야 하는데, 그려면 불가피하게 통계적인 방법을 쓸 수 밖에 없게 됩니다. 이런 이유로 분야와 주제에 따라서는 아닌 경우도 있겠지만, 상당수 논문에서는 통계학이 들어가게 됩니다. 문제는 데이터를 처리하고 분석하는 방법을 익히는 데도 상당한 시간과 노력이 필요하다는 점입니다. 물론 대부분의 학과에서 통계 수업이 들어가기는 하지만, 그것만으로는 충분하지 않은 경우가 많습니다. 대학 학부 과정에서는 대부분 논문 제출이 필요없거나 필요하다고 해도 그렇게 높은 수준을 요구하지 않지만, 대학원 이상 과정에서는 SCI/SCIE 급 논문이 필요하게 되어 처음 논문을 작성하는 입장에서는 상당히 부담되는 상황에 놓이게 됩니다. 그리고 이후 논문을 계속해서 쓰게 될 경우 통계 문제는 항상 나를 따라다니면서 괴롭히게 될 것입니다. 사정이 이렇다보니 간혹 통계 공부를 어떻게 하는 것이 좋겠냐는 질문이 들어옵니다. 사실 저는 통계 전문가라고 하기에는 실력은 모자라지만, 대신 앞서서 삽질을 한 경험이 있기 때문에 몇 가지 조언을 해줄 수 있을 것 같습니다. 1. 입문자를 위한 책을 추천해달라 사실 예습을 위해서 미리 공부하는 것은 추천하지 않습니다. 기본적인 통계는 학과별로 다르지 않더라도 주로 쓰는 분석방법은 분야별로 상당한 차이가 있을 수 있어 결국은 자신이 주로 하는 부분을 잘 해야 하기 때문입니다. 그러기 위해서는 학과 커리큘럼에 들어있는 통계 수업을 듣는 것이 더 유리합니다. 잘 쓰지도 않을 방법을 열심히 공부하는 것은 아무래도 효율

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150년 만에 다시 울린 희귀 곤충의 울음 소리

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9000년 전 소녀의 모습을 복원하다.

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