기본 콘텐츠로 건너뛰기

박테리아 내부에서 핵을 만드는 거대 바이러스

 


(Cryo-electron tomography technology provides a view of a jumbo phage-infected bacterial cell (top left) with the nucleus-like compartment outlined in blue (top right). A close-up of the cell (bottom left) reveals the newly discovered chimallin protein and the chimallin protein's square lattice design (bottom right), with yellow highlighting an individual chimallin shell component. Credit: Villa Lab, UC San Diego)





(A cryo-EM depiction of jumbo phage compared with a T4 phage virus and a ribosome particle. Credit: Villa Lab, UC San Diego)




(A fluorescence microscopy image reveals a bacterial cell infected by jumbo phage revealing the bacterial cell membrane (red), phage nucleus shell (green) and phage DNA (blue). Credit: Pogliano Lab, UC San Diego)





(Twenty-four individual chimallin proteins assemble as a cube inside cells of infected bacteria. Thousands of chimallin components assemble into tiles that ultimately make up square sheets of the phage nucleus shell. Credit: Villa Lab, UC San Diego)



 바이러스와 박테리아는 인간 입장에서는 모두 위험한 병원체처럼 여겨지지만, 사실 둘 사이야 말로 수십 억 년 된 숙적 관계라고 할 수 있습니다. 더 복잡한 다세포 생물이 나타나기 한참 전부터 바이러스는 박테리아의 자원을 이용해 자기를 복제했고 박테리아는 이런 바이러스의 감염을 막기 위해 면역 시스템을 갖췄습니다.



 이 둘의 진화적 군비 경쟁은 과학자들의 관심을 끌었습니다. 바이러스나 박테리아의 진화를 이해하는데 도움이 될 뿐 아니라 새로운 치료법을 개발하는데도 도움이 될 수 있기 때문입니다. 



 캘리포니아 대학 샌디에이고 캠퍼스의 과학자들은 과거 알려지지 않은 바이러스의 박테리아 면역 회피 기전을 발견했습니다. 연구팀이 발견한 것은 거대 점보 바이러스(jumbo bacteriophage)가 박테리아 내부에 진핵 세포의 핵과 비슷한 구조물을 만드는 것입니다. 



 일반적으로 진핵 세포의 핵은 매우 중요한 유전 정보를 안전하게 보호하는 역할을 담당합니다. 그리고 거대 바이러스의 핵도 비슷한 목적으로 진화했습니다. 바로 바이러스의 DNA를 숙주의 공격으로부터 보호하는 일입니다. 



 연구팀은 바이러스의 핵 구조가 치말리 (chimalli)이라는 단백질이 여러 개 모인 단순한 구조이지만, 진핵 세포의 핵처럼 DNA를 잘 보호하고 물질 교환을 돕는 구조라는 점을 확인했습니다. 이 단백질은 실험실에서는 큐브 구조를 만들지만, 세포 내에서는 거대한 벽지 같은 구조로 바이러스 DNA를 보호했습니다. 



 이렇게 예상치 못한 바이러스의 자기 보호 능력은 수십 억 년에 걸친 진화적 군비 경쟁의 결과입니다. 숙주의 면역을 어떻게든 회피하고 자신을 방어하기 위해 독특한 거대 구조물까지 만드는 것입니다. 한편으로는 놀랍다는 생각이들면서도 섬뜩하기도한 바이러스의 진화입니다. 




 참고 


Thomas G. Laughlin et al, Architecture and self-assembly of the jumbo bacteriophage nuclear shell, Nature (2022). DOI: 10.1038/s41586-022-05013-4



https://phys.org/news/2022-08-giant-viruses-cell-nucleus-surprisingly.html

라벨:

댓글

댓글 쓰기

이 블로그의 인기 게시물

통계 공부는 어떻게 하는 것이 좋을까?

 사실 저도 통계 전문가가 아니기 때문에 이런 주제로 글을 쓰기가 다소 애매하지만, 그래도 누군가에게 도움이 될 수 있다고 생각해서 글을 올려봅니다. 통계학, 특히 수학적인 의미에서의 통계학을 공부하게 되는 계기는 사람마다 다르긴 하겠지만, 아마도 비교적 흔하고 난감한 경우는 논문을 써야 하는 경우일 것입니다. 오늘날의 학문적 연구는 집단간 혹은 방법간의 차이가 있다는 것을 객관적으로 보여줘야 하는데, 그려면 불가피하게 통계적인 방법을 쓸 수 밖에 없게 됩니다. 이런 이유로 분야와 주제에 따라서는 아닌 경우도 있겠지만, 상당수 논문에서는 통계학이 들어가게 됩니다.   문제는 데이터를 처리하고 분석하는 방법을 익히는 데도 상당한 시간과 노력이 필요하다는 점입니다. 물론 대부분의 학과에서 통계 수업이 들어가기는 하지만, 그것만으로는 충분하지 않은 경우가 많습니다. 대학 학부 과정에서는 대부분 논문 제출이 필요없거나 필요하다고 해도 그렇게 높은 수준을 요구하지 않지만, 대학원 이상 과정에서는 SCI/SCIE 급 논문이 필요하게 되어 처음 논문을 작성하는 입장에서는 상당히 부담되는 상황에 놓이게 됩니다.  그리고 이후 논문을 계속해서 쓰게 될 경우 통계 문제는 항상 나를 따라다니면서 괴롭히게 될 것입니다.  사정이 이렇다보니 간혹 통계 공부를 어떻게 하는 것이 좋겠냐는 질문이 들어옵니다. 사실 저는 통계 전문가라고 하기에는 실력은 모자라지만, 대신 앞서서 삽질을 한 경험이 있기 때문에 몇 가지 조언을 해줄 수 있을 것 같습니다.  1. 입문자를 위한 책을 추천해달라  사실 예습을 위해서 미리 공부하는 것은 추천하지 않습니다. 기본적인 통계는 학과별로 다르지 않더라도 주로 쓰는 분석방법은 분야별로 상당한 차이가 있을 수 있어 결국은 자신이 주로 하는 부분을 잘 해야 하기 때문입니다. 그러기 위해서는 학과 커리큘럼에 들어있는 통계 수업을 듣는 것이 더 유리합니다...
댓글 4개
자세한 내용 보기

9000년 전 소녀의 모습을 복원하다.

( The final reconstruction. Credit: Oscar Nilsson )  그리스 아테나 대학과 스웨덴 연구자들이 1993년 발견된 선사 시대 소녀의 모습을 마치 살아있는 것처럼 복원하는데 성공했습니다. 이 유골은 그리스의 테살리아 지역의 테오페트라 동굴 ( Theopetra Cave )에서 발견된 것으로 연대는 9000년 전으로 추정됩니다. 유골의 주인공은 15-18세 사이의 소녀로 정확한 사인은 알 수 없으나 괴혈병, 빈혈, 관절 질환을 앓고 있었던 것으로 확인되었습니다.   이 소녀가 살았던 시기는 유럽 지역에서 수렵 채집인이 초기 농경으로 이전하는 시기였습니다. 다른 시기와 마찬가지로 이 시기의 사람들도 젊은 시절에 다양한 질환에 시달렸을 것이며 평균 수명 역시 매우 짧았을 것입니다. 비록 젊은 나이에 죽기는 했지만, 당시에는 이런 경우가 드물지 않았을 것이라는 이야기죠.   아무튼 문명의 새벽에 해당하는 시점에 살았기 때문에 이 소녀는 Dawn (그리스어로는  Avgi)라고 이름지어졌다고 합니다. 연구팀은 유골에 대한 상세한 스캔과 3D 프린팅 기술을 적용해서 살아있을 당시의 모습을 매우 현실적으로 복원했습니다. 그리고 그 결과 나타난 모습은.... 당시의 거친 환경을 보여주는 듯 합니다. 긴 턱은 당시를 살았던 사람이 대부분 그랬듯이 질긴 먹이를 오래 씹기 위한 것으로 보입니다.   강하고 억센 10대 소녀(?)의 모습은 당시 살아남기 위해서는 강해야 했다는 점을 말해주는 듯 합니다. 이렇게 억세보이는 주인공이라도 당시에는 전염병이나 혹은 기아에서 자유롭지는 못했기 때문에 결국 평균 수명은 길지 못했겠죠. 외모 만으로 평가해서는 안되겠지만, 당시의 거친 시대상을 보여주는 듯 해 흥미롭습니다.   참고  https://phys.org/news/2018-01-te...
댓글 쓰기
자세한 내용 보기

150년 만에 다시 울린 희귀 곤충의 울음 소리

  ( The katydid Prophalangopsis obscura has been lost since it was first collected, with new evidence suggesting cold areas of Northern India and Tibet may be the species' habitat. Credit: Charlie Woodrow, licensed under CC BY 4.0 ) ( The Museum's specimen of P. obscura is the only confirmed member of the species in existence. Image . Credit: The Trustees of the Natural History Museum, London )  과학자들이 1869년 처음 보고된 후 지금까지 소식이 끊긴 오래 전 희귀 곤충의 울음 소리를 재현하는데 성공했습니다. 프로팔랑곱시스 옵스큐라 ( Prophalangopsis obscura)는 이상한 이름만큼이나 이상한 곤충으로 매우 희귀한 메뚜기목 곤충입니다. 친척인 여치나 메뚜기와는 오래전 갈라진 독자 그룹으로 매우 큰 날개를 지니고 있으며 인도와 티벳의 고산 지대에 사는 것으로 보입니다.   유일한 표본은 수컷 성체로 2005년에 암컷으로 생각되는 2마리가 추가로 발견되긴 했으나 정확히 같은 종인지는 다소 미지수인 상태입니다. 현재까지 확실한 표본은 수컷 성체 한 마리가 전부인 미스터리 곤충인 셈입니다.   하지만 과학자들은 그 형태를 볼 때 이들 역시 울음 소리를 통해 짝짓기에서 암컷을 유인했을 것으로 보고 있습니다. 그런데 높은 고산 지대에서 먼 거리를 이동하는 곤충이기 때문에 낮은 피치의 울음 소리를 냈을 것으로 보입니다. 문제는 이런 소리는 암컷 만이 아니라 박쥐도 잘 듣는다는 것입니다. 사실 이들은 중생대 쥐라기 부터 존재했던 그룹으로 당시에는 박쥐가 없어 이런 방식이 잘 통했을 것입니다. 하지만...
댓글 쓰기
자세한 내용 보기