(Scientifically accurate atomic model of the external structure of the SARS-CoV-2. Each "ball" is an atom. Scientific consultants: Nikitin N.A., Doctor of Biological Sciences, Department of Virology, Faculty of Biology, Lomonosov Moscow State University.
Borisevich S.S. Candidate of Chemical Sciences, Specialist in Molecular Modeling of Viral Surface Proteins, Senior Researcher, Laboratory of Chemical Physics, Ufa Institute of Chemistry RAS
Arkhipova V.I., specialization in Fundamental and Applied chemistry, senior engineer, RNA Chemistry Laboratory, Institute of chemical biology and fundamental medicine SB RAS. Credit: Alexey Solodovnikov (Idea, Producer, CG, Editor), Valeria Arkhipova (Scientific Сonsultant))
지난 11월 9일 아프리카 보츠와나에서 처음 보고된 새로운 SARS-CoV-2 변이인 lineage B.1.1.529가 이례적으로 많은 돌기 단백질의 변이를 포함하고 있어 코로나 19 대유행의 새로운 변수로 등장했습니다. 처음에는 누 (Nu, N) 변이로 불리다 WHO에 의해 오미크론 (Omicron, O) 관심 변이 (VOC)로 다시 지정되었는데, 11월 26일 관심 변이로 지정할 만큼 이례적인 주목을 받고 있습니다.
이렇게 주목을 받은 이유는 하나의 변이가 돌기 단백질에 무려 32가지 아미노산 변화를 지니고 있기 때문입니다. 30개의 아미노산이 변했고, 3개가 사라졌으며 1개가 추가되어 (3-1=2) 모두 32개입니다. (A67V, Δ69-70, T95I, G142D, Δ143-145, Δ211, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493K, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F). Out of these changes, 15 are located in the receptor binding domain (residues 319-541). The variant also carries a number of changes and deletions in other genomic regions (NSP3 – K38R, V1069I, Δ1265, L1266I, A1892T; NSP4 – T492I; NSP5 – P132H; NSP6 – Δ105-107, A189V; NSP12 – P323L; NSP14 – I42V; E – T9I; M – D3G, Q19E, A63T; N – P13L, Δ31- 33, R203K, G204R) 그런 만큼 백신을 접종해서 생긴 중화 항체나 코로나 19 감염으로 생긴 중화 항체 모두 이 변이에 취약할 수 있습니다.
현재 오미크론 변이는 남아프리카 공화국을 중심으로 아프리카 남부 지역에서 주로 보고되고 있습니다. 아직은 대규모 유행 전 단계라 백신에 대한 돌파 감염이나 과거 확진자에 대한 재감염, 중증화 및 사망률에 대한 정보는 확실치 않은 상태이지만, 미국과 유럽에서 재빠르게 해당 유행 국가의 빗장을 걸어 잠근 이유는 워낙 많은 변이가 있어 돌파감염이나 재감염 위험도가 크다고 보기 때문입니다. 델타 변이로 큰 어려움을 겪은 세계 각국은 당연히 크게 긴장할 수밖에 없습니다.
다만 실제로 델타보다 더 전파력이 강한지, 돌파 감염이나 재감염이 얼마나 더 흔한지는 추가 정보가 필요한 상황입니다. 최악의 경우를 대비해서 백신 제조사들은 이미 이 변이에 대한 새 백신 개발에 들어간 상태입니다. 그러나 효과적인 새 백신이 개발된다고 해도 다시 재접종하는데 필요한 시간과 비용을 생각하면 가능하면 재접종이 필요 없는 경우가 가장 바람직합니다.
추가적인 정보가 나오면 다시 포스팅 하게 될 것 같습니다.
참고
https://en.wikipedia.org/wiki/SARS-CoV-2_Omicron_variant
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